厦门岛有跨海长堤与大陆连接，铁路可直抵厦门市区。目前，厦门有始发至北京、上海、南京、杭州、合肥、南昌、鹰潭、西安、重庆等地的旅客列车。2010年4月26日福厦铁路通车，福州到厦门仅需要90分钟。厦门火车站和厦门北站都有动车组发往福州，途经长乐、福清、莆田、涵江、仙游、惠安、晋江、翔安、同安、集美。同时开通的还有沪厦动车组。沪厦动车组票价为二等座359元。D3201次，上海南站8时05分开，厦门16时06分到；D3203次，上海南站10时50分开，厦门18时40分到。厦门主要铁路干线 鹰厦铁路：起于江西鹰潭，止于厦门。
福厦铁路：起于福建福州，止于厦门，省内第二条高速铁路，2010年开通客运运营。龙厦铁路：起于福建龙岩，止于厦门。线路全长约140多千米，设计时速200公里/小时，预计2011年底建成通车。厦深铁路：起于福建厦门，止于广东深圳。规划里程约550千米，设计时速250千米，预计2011年底建成。厦门火车站交通 厦门火车站交通 ：位于厦禾路和湖东路交叉口，有多班公交车可达，主要有16、18、21、25、26、28、37路等。出火车站沿厦禾路向西行，可到达去鼓浪屿的船码头。厦门北站交通：目前厦64、厦50、集5、集7线终点站已经由工商旅游学校调整至厦门北站；
新增690、790、980路公交，始发站为厦门北站；另外集 9、403、409、416经停厦门北站。除此以外，BRT链接厦门北站的链接线也能到达厦门北站，厦门岛内可以乘坐BRT到中科院BRT站，换乘临时开通的10路常规公交线，终点站到达。小贴士：福厦铁路线厦门北站是原来的厦门西站，位置在集美区后溪镇，而原鹰厦线厦门北站现在更名为高崎站。