昆明作为云南铁路动脉的重点，是12条铁路干支线组成的铁路枢纽站，主要线路有：成昆铁路，沪昆铁路，南昆铁路，内昆铁路，昆丽铁路及昆河铁路等，沪昆高铁，京昆高铁，昆曼高铁，云桂铁路，成昆快铁，昆明环城快铁在建。昆明站有发往北京、成都、上海、重庆、厦门、郑州、南宁、南昌、西安、广州、武汉、贵阳、杭州等方向的共90列列车。昆明站 昆明中心站，成昆铁路，沪昆铁路，南昆铁路，内昆铁路，昆丽铁路列车终到站，共82对列车始发/终到 昆明南站 未来昆明最大的火车站，位于呈贡新区中心，沪昆客运专线、京昆客运专线、云桂（广州至昆明）快速铁路、环滇池铁路、城市米轨列车铁路终到站，所有动车组停靠站。
现以货运为主，建有南站货运集装箱中心，南昆线慢车停车站，共四对列车经停 昆明东站 昆明最大的货场站 昆明西站 货运为主，成昆线慢车停车站，共四对列车经停 昆明北站 货运列车站，昆河米轨停车站，目前仅有从昆明市区石咀站——王家营站列车经停